Inhoudsopgave
Advertenties
In-silico voorspellingen van mogelijke kruisreacties hebben getoond dat de volgende
kruisreacties kunnen plaatsvinden wanneer ontlastingsmonsters worden getest met het QIAstat-Dx
Gastrointestinal Panel 2 (tabel 9) (5, 15−17).
Tabel 9. Mogelijke kruisreacties op basis van in-silico analyse
QIAstat-Dx Gastrointestinal Panel 2-doelwit
Enteropathogene E. coli (EPEC)
Campylobacter spp.
Shiga-achtige toxine-producerende E. coli (STEC) stx1
Shiga-achtige toxine-producerende E. coli (STEC) stx2
E. coli O157
* Merk op dat deze mogelijke kruisreacties invloed hebben op ontwerpen met doelgenen die verantwoordelijk zijn voor
de pathogeniteit van de overeenkomstige QIAstat-Dx Gastrointestinal Panel 2-doelpathogenen, die kunnen worden
verworven binnen soorten in een bekend biologisch proces in bacteriën dat 'horizontale genoverdracht' wordt
genoemd.
Zelden of minder vaak voorkomende eae-intiminedragende organismen.
†
Doelwit binnen paneel.
‡
In-vitro tests van stammen van Campylobacter lari en Campylobacter helveticus bij hoge concentraties bevestigden een
§
mogelijke kruisreactie van deze Campylobacter-soorten met de QIAstat-Dx Gastrointestinal Panel 2-assay.
Zelden of minder vaak voorkomende producenten van Stx-toxinen.
¶
**E. coli O157 zal enkel worden opgeroepen wanneer er een positieve amplificatie is voor het E. coli (STEC)-ontwerp
volgens het oproepalgoritme. Een weinig voorkomend geval van een co-infectie van E. coli (STEC) zal E. coli O157
zal niet worden onderscheiden van een enkele infectie veroorzaakt door een STEC O157:H7-stam.
Inclusiviteit (analytische reactiviteit)
De analytische reactiviteit (inclusiviteit) werd geëvalueerd met isolaten/stammen van gastro-
intestinale pathogenen die zijn geselecteerd op basis van klinische relevantie en genetische,
temporele en geografische diversiteit. Op basis van in-vitro (natte) tests en in-silico analyse
zijn de QIAstat-Dx Gastrointestinal Panel 2-primers en -probes specifiek en inclusief voor
klinisch gangbare en relevante stammen voor elke geteste pathogeen.
82
Gebruiksaanwijzing (Handleiding) van QIAstat-Dx Gastrointestinal Panel 2 02/2023
Mogelijke kruisreagerende organismen
Shigella boydii *
, Escherichia albertii *
†‡
Campylobacter lari
, Campylobacter helveticus
§
Shigella sonnei *
, Shigella dysenteriae*
‡
Acinetobacter haemolyticus*
Enterobacter cloacae*
, Aeromonas caviae*
¶
Escherichia albertii *
¶
Niet-STEC E. coli O157-stammen**
†
§
‡
, Citrobacter freundi*
,
¶
¶
¶
Advertenties
Inhoudsopgave
