Inhoudsopgave
Advertenties
Markers van genetische virulentie gerelateerd aan diarree veroorzakende pathotypen van
E.coli/Shigella worden vaak gedragen op mobiele genetische elementen (MGE's) die
horizontaal kunnen worden overgebracht tussen verschillende stammen. Daarom kunnen
resultaten van 'Detected' (Gedetecteerd) voor meerdere diarree veroorzakende E.
coli/Shigella toe te schrijven zijn aan co-infectie met meerdere pathotypen of, minder
vaak, aan de aanwezigheid van een enkel organisme met de genen die kenmerkend zijn
voor meerdere pathotypen. Een voorbeeld van dat laatste geval zijn de hybride
ETEC/STEC-stammen van 2019 E. coli die in Zweden zijn aangetroffen*.
Het QIAstat-Dx Gastrointestinal Panel 2 detecteert warmtestabiele toxinevarianten (ST1a
en ST1b) en de warmtelabiele toxine (LT) van enterotoxigene E. coli (ETEC), die in verband
worden gebracht met ziekte bij de mens. De variant LT-II-toxine (structureel vergelijkbaar
met LT) en de STB/ST2-toxine (structureel niet vergelijkbaar met ST1) zijn niet het doelwit
van de ontwerpen van ETEC-oligonucleotide en worden niet beschouwd als belangrijk
voor ziekte bij de mens.
Het QIAstat-Dx Gastrointestinal Panel 2 detecteert enteropathogene E. coli (EPEC) door
zich te richten op het eae-gen, dat de adhesine intimine codeert. Aangezien sommige
shiga-achtige toxine-producerende E. coli (STEC) ook eae dragen (met name stammen
geïdentificeerd
Gastrointestinal Panel 2 geen onderscheid maken tussen STEC die eae bevat en een co-
infectie van EPEC en STEC. Daarom is het EPEC-resultaat niet van toepassing (N/A) en
wordt het niet gerapporteerd voor specimens waarin ook STEC is gedetecteerd. In
zeldzame gevallen kan STEC worden gerapporteerd als EPEC wanneer een STEC die eae
draagt (EHEC) aanwezig is in een specimen onder de LoD van de ontwerpen van STEC-
oligonucleotide (stx1/stx2). Zeldzame gevallen van andere organismen die eae dragen
zijn gedocumenteerd; bijv. Escherichia albertii en Shigella boydii.
* Bai X, Zhang J, Ambikan A, et al. Molecular Characterization and Comparative Genomics of Clinical Hybrid Shiga
Toxin-Producing and Enterotoxigenic Escherichia coli (STEC/ETEC) Strains in Sweden. Sci Rep. 2019;9(1):5619.
Published 2019 Apr 4. doi:10.1038/s41598-019-42122-z
70
als
enterohemorragische
Gebruiksaanwijzing (Handleiding) van QIAstat-Dx Gastrointestinal Panel 2 02/2023
E.
coli;
EHEC),
kan
het
QIAstat-Dx
Advertenties
Inhoudsopgave
