Sequencing-Uitvoerbestanden - illumina NextSeq 550Dx Referentie Gids
Verberg thumbnails
Zie ook voor NextSeq 550Dx:
- Referentie gids (76 pagina's) ,
- Gebruiksaanwijzing (78 pagina's)
Inhoudsopgave
Advertenties
Referentiegids van het NextSeq 550Dx-instrument
Sequencing-uitvoerbestanden
Bestandstype
Basebepalingsbestanden
Indexbestand
basebepaling
Clusterlocatiebestanden
Filterbestanden
Documentnr. 1000000009513 v08
VOOR GEBRUIK BIJ IN-VITRODIAGNOSTIEK.
Bestandsbeschrijving, locatie en naam
Elke geanalyseerde tegel wordt opgenomen in een
basebepalingsbestand, samengevoegd in 1 bestand voor elke
baan, voor elke cyclus. Het samengevoegde bestand bevat de
basebepaling en de gecodeerde kwaliteitsscore voor elke cluster
van die baan.
Gegevens\Intensiteiten\Basebepalingen\L00[X] – De
bestanden worden voor elke baan in 1 map opgeslagen.
[Cycle].bcl.bgzf, waarbij [Cycle] het cyclusnummer in 4 cijfers
weergeeft. Basebepalingsbestanden worden gecomprimeerd met
een block gzip-compressie.
Een binair indexbestand vermeldt voor elke baan de
oorspronkelijke tegelinformatie in een paar waarden voor elke
tegel, namelijk het tegelnummer en het aantal clusters voor de
tegel.
De indexbestanden van de basebepalingen worden aangemaakt
wanneer voor het eerst een basebepalingsbestand voor die baan
wordt aangemaakt.
Gegevens\Intensiteiten\Basebepalingen\L00[X] – De
bestanden worden voor elke baan in 1 map opgeslagen.
s_[Lane].bci
Bij elke tegel worden de XY-coördinaten voor elk cluster
samengevoegd in 1 clusterlocatiebestand voor elke baan.
Clusterlocatiebestanden zijn het resultaat van het maken van een
sjabloon.
Gegevens\Intensiteiten\L00[X] – De bestanden worden voor
elke baan in 1 map opgeslagen.
s_[lane].locs
Het filterbestand specificeert of een cluster door filters is
doorgelaten. Filterinformatie wordt samengevoegd in 1
filterbestand voor elke baan en bepaling.
Filterbestanden worden bij cyclus 26 gegenereerd op basis van
gegevens van 25 cycli.
Gegevens\Intensiteiten\Basebepalingen\L00[X] – De
bestanden worden voor elke baan in 1 map opgeslagen.
s_[lane].filter
76
Advertenties
Inhoudsopgave
Probleemoplossen
