illumina NextSeq 550Dx Referentie Gids pagina 81
Verberg thumbnails
Zie ook voor NextSeq 550Dx:
- Referentie gids (76 pagina's) ,
- Gebruiksaanwijzing (78 pagina's)
Inhoudsopgave
Advertenties
Referentiegids van het NextSeq 550Dx-instrument
Kwaliteitsscore
Een kwaliteitsscore, of Q-score, is een voorspelling van de kans op een onjuiste basebepaling. Een
hogere Q-score duidt erop dat een basebepaling van een hogere kwaliteit is en daardoor waarschijnlijk
juist is.
De Q-score is een compacte manier om een kleine kans op fouten te communiceren. Kwaliteitsscores
worden vermeld als Q(X), waarbij X de score is. De volgende tabel toont de relatie tussen de
kwaliteitsscore en de foutenkans.
Q-score Q(X)
Foutenkans
Q40
0,0001 (1 op 10.000)
Q30
0,001 (1 op 1.000)
Q20
0,01 (1 op 100)
Q10
0,1 (1 op 10)
OPMERKING
De kwaliteitsscore is gebaseerd op een aangepaste versie van het
Phred-algoritme.
Voor de kwaliteitsscore wordt voor elke basebepaling een set voorspellers berekend en worden
vervolgens de voorspellende waarden gebruikt om de Q-score in een kwaliteitstabel op te zoeken. De
kwaliteitstabellen zijn opgesteld om optimaal nauwkeurige kwaliteitsvoorspellingen te doen voor runs
die zijn gegenereerd door middel van een specifieke configuratie van sequencingplatform en
chemieversie.
Na bepaling van de Q-score worden de resultaten in basebepalingsbestanden (*.bcl.bgzf)
geregistreerd.
Documentnr. 1000000009513 v08
VOOR GEBRUIK BIJ IN-VITRODIAGNOSTIEK.
74
Advertenties
Inhoudsopgave
Probleemoplossen
