Inhoudsopgave
Advertenties
In-vitro tests: analytische monsters van elk doelwit dat was opgenomen in het QIAstat-Dx ME
Panel werden getest om de reactiviteit van het assay te evalueren. In het onderzoek werden
178 monsters opgenomen die representatief waren van de relevante stammen, subtypen,
serotypen en genotypen voor de verschillende organismen (bv. een bereik van verschillende
meningitis-/encefalitisstammen wereldwijd geïsoleerd en van verschillende kalenderjaren).
In-silico analyse: er is in-silico analyse uitgevoerd om assay-reactiviteitsvoorspellingen te doen
van alle oligonucleotide-sequenties van primers-probe die waren opgenomen in het panel ten
opzichte van openbaar beschikbare sequentie-databases om mogelijke kruisreacties of
onverwachte detectie van elke primerset te detecteren. Bovendien werden stammen die niet
beschikbaar waren voor in-vitro tests opgenomen in de in-silico analyse om de voorspelde
inclusiviteit van de verschillende stammen van dezelfde organismen te bevestigen.
Tabel 10. Klinisch relevante stammen/subtypen gedetecteerd per pathogeen
Pathogeen
Neisseria meningitidis
(ingekapseld)
Cryptococcus gattii/
Cryptococcus neoformans
Humaan parechovirus
Listeria monocytogenes
Humaan herpesvirus 6
Haemophilus influenzae
Enterovirus
Escherichia coli K1
De stammen die op inclusiviteit werden getest, staan vermeld in tabel 11.
54
Gebruiksaanwijzing (Handleiding) van QIAstat-Dx Meningitis/Encephalitis (ME) Panel 09/2022
Klinisch relevante stammen/subtypen gedetecteerd
Ingekapselde serotypen (A, B, C, D, E, H, I, K, L, NG, W, W135, X, Y, Z, 29E)
Serotype A (C. neoformans var neoformans), serotype D (C. neoformans var grubii),
serotypen B en C (C. gattii inclusief alle VGI, VGII, VGIII, VGIV molecuultypen)
Alle stammen Humaan parechovirus A met beschikbare 5'-UTR-sequentie (1, 2, 3,
4, 5, 6, 7, 8, 14, 16, 17, 18 en 19), inclusief echovirus 22 (HPeV-1) en echovirus
23 (HPeV-2). Hoewel er polyproteïnesequenties aanwezig waren voor HPeV-A-
stammen 9, 10, 11, 12, 13 en 15, was er geen beschikbare 5'-UTR-sequentie.
Serotypen 1/2a,1/2b, 1/2c, 3a, 3b, 3c, 4a, 4b, 4c, 4d, 4e, 7
HHV6a en HHV6b
Alle ingekapselde serotypen (a, b, c, d, e, f) en niet ingekapselde stammen (niet-
typeerbaar, NTHi) inclusief var. H. aegyptus
Coxsackievirus A (CV-A1 tot en met CV-A24), coxsackievirus B (CV-B1 tot en met
CV-B6), Echovirus (E-1 tot en met E-33), Enterovirus A (EV-A71, EV-A76, EV-A89 tot
en met EV-A92, EV-A119, EV-A120), Enterovirus B (EV-B69, EV-B73 tot en met EV-
B75, EV-B79, EV-B80 tot en met EV-B88, EV-B93, EV-B97, EV-B98, EV-B100, EV-
B101, EV-B106, EV-B107, EV-B111), Enterovirus C (EV-C96, EV-C99, EV-C102, EV-
C104, EV-C105, EV-C109, EV-C116 tot en met EV-C118), Enterovirus D (EV-D68,
EV-D70, EV-D94), Poliovirus (PV-1 tot en met PV-3)
K1-stammen
Advertenties
Inhoudsopgave
