Referentiegids onderzoeksmodus NextSeq 550Dx-instrument
RTA-fouten
Controleer eerst het RTA-foutenlogboek, dat is opgeslagen in de map RTALogs, om problemen met RTA-
fouten op te lossen. Dit bestand is niet aanwezig bij geslaagde runs. Voeg het foutenlogboek bij als u
problemen meldt aan de technische ondersteuning van Illumina.
Probleemoplossingsbestanden voor array-scans
Hoofdbestand
Scanparametersbestand
(ScanParameters.xml)
Logboekbestanden
Meetwaardenbestanden
Opnieuw-gescand
bestand
Fouten bij automatische controle oplossen
Als er fouten optreden tijdens de automatische controle, gebruik dan de volgende aanbevolen acties om
de fout op te lossen.
Controles voor sequencing-runs
Als een pre-runcontrole mislukt, is de RFID van de reagenscartridge niet vergrendeld en kan deze voor een
volgende run worden gebruikt. De RFID's van de stroomcel, reagenscartridge en buffercartridge worden
echter vergrendeld tijdens een initialisatie van de besturingssoftware, wat vereist kan zijn om een fout op
te lossen. De gebruiker moet de stroomcel, reagenscartridge en buffercartridge verwijderen uit het
instrument voordat het systeem wordt herstart. Daarnaast worden de RFID's van verbruiksartikelen
vergrendeld nadat de folieafsluitingen zijn doorgeprikt. Zodra een stroomcel-RFID door de software is
gelezen, wordt een timer van 7 uur gestart voordat de stroomcel als vergrendeld en onbruikbaar wordt
beschouwd.
Systeemcontroles
Aanbevolen actie
Kleppen gesloten
Zorg ervoor dat de kleppen van het compartiment dicht zijn.
Verbruiksartikelen
Sensoren voor verbruiksartikelen registreren de verbruiksartikelen niet. Zorg ervoor dat elk
geladen
verbruiksartikel correct geplaatst is.
Selecteer in het scherm run setup (Runinstellingen) Back (Terug) om terug te keren naar de
laadstap en stel de runinstellingen opnieuw in.
Vereiste software
Essentiële componenten van de software ontbreken.
Neem contact op met de technische ondersteuning van Illumina.
Documentnr.1000000041922 v03 NLD
Uitsluitend bedoeld voor onderzoeksdoeleinden.
Niet voor gebruik in diagnostische procedures.
Map
Omschrijving
Hoofdmap
Bevat informatie over scanparameters. Informatie omvat scandatum, BeadChip-
barcode, locatie van clusterbestand en locatie van manifestbestand.
Logboeken
Logboekbestanden beschrijven elke stap die tijdens de scan op het instrument is
uitgevoerd.
[Barcode]
Meetwaarden worden aangeboden als monstermeetwaarden en als
sectiemeetwaarden.
[barcode]_sample_metrics.csv – geeft voor elk monster en kanaal (rood en groen) de
gegevens Percentage van beeld, Percentage uitschieters, P05, P50, P95, Gem
FWHM Gem, FWHM Stdafw en Min Registratie Score.
[barcode]_section_metrics.csv – geeft voor elke sectie en tegel de gegevens:
Laser Z-positie, Through Focus Z-positie, Rood FWHM, Groen FWHM, Rood gem
pixelintensiteit, Groen gem pixelintensiteit, Rode-registratiescore en Groene-
registratiescore.
[Barcode]
[barcode]_rescan.flowcell – geeft de voor een herscan aangepaste tegellocaties, die
een hogere tegeloverlapping omvatten.
42