Inhoudsopgave
Advertenties
5 Gebruik
5.3 Runinstellingen
5.3
Runinstellingen
Inleiding
Deze paragraaf beschrijft de aanbevolen instellingen voor een elektroforeserun. De
optimale instellingen moet proefondervindelijk worden vastgesteld.
Snelle runs onder hoge spanning
Bepaalde toepassingen, zoals het screenen van monsters of controle van de zuiverheid
van het monster, kunnen snel worden uitgevoerd onder hoogspanningscondities. Koel
de basis (-20 °C) en begrens de run tot 5 minuten of minder bij 500 V.
Tragere runs onder lagere spanning
Voor het berekenen van de spanningsgradiënt deelt u de spanningsinstelling door de
afstand tussen de elektrodes (12,7 cm).
Een spanningsgradiënt van 12 V/cm (150 V) scheidt 0,1 tot 23 kb fragmenten van een
Hind III digest λ DNA in 30 tot 40 minuten (met 1% agarosegel en 0,5× TBE runbuffer).
Met dezelfde oplossingen kan dit monster tevens in 20 tot 30 minuten worden uitge-
voerd bij 24 V/cm (300 V) met een aanvaardbare bandresolutie. Koel de basis vóór
gebruik.
Aanbevolen instellingen
De volgende tabel toont de aanbevolen spanning en tijden voor 1% Agarose NA, 0,5×
TBE en een gekoelde basis.
Spanning (V)
500
400
300
200
150
1
Gebruik 0,5× TBE en koel de basis vóór gebruik tot -20 °C voor snelle runs van 20 minuten of
minder.
30
Gradiënt (V/cm)
Tijd (min)
1
40
5
31
10
24
20
16
30 tot 40
12
30 tot 60
1
1
Mini Submarine Unit Gebruiksaanwijzing 29281780 AB
Advertenties
Hoofdstukken
Inhoudsopgave
