Hoofdstuk 2 NextSeq 550Dx-software
Overzicht NextSeq 550Dx-software
Overzicht Local Run Manager
Gebruikerswachtwoorden
Overzicht NextSeq 550Dx-software
De software die in dit hoofdstuk wordt beschreven, wordt gebruikt om gegevens van het NextSeq 550Dx-
instrument te configureren, uit te voeren en te analyseren. De software van het instrument omvat
geïntegreerde toepassingen die sequencing-runs uitvoeren. Software-updates worden uitgevoerd door
personeel van Illumina.
Local Run Manager software – Geïntegreerde softwareoplossing voor het aanmaken van een run en het
u
analyseren van resultaten (secundaire analyse). De software controleert ook de gebruikersrechten. Zie
Overzicht Local Run Manager op pagina 11
NextSeq 550Dx Operating Software (NOS) – Bestuurt de werking van het instrument.
u
De software is vooraf geïnstalleerd op de NextSeq 550Dx en draait op het instrument. De NOS voert
u
de run uit volgens de parameters die zijn gespecificeerd in de softwaremodule Local Run Manager.
Voordat u begint met de sequencing-run, selecteert u een run die u hebt aangemaakt met Local Run
u
Manager. De NOS-software-interface begeleidt u door de stappen voor het laden van de stroomcel
en de reagentia.
Gedurende de run regelt de software de stroomcelfase, geeft reagentia af, regelt fluïdica, stelt
u
temperaturen in, legt beelden vast van clusters op de stroomcel en biedt een visuele samenvatting
van kwaliteitsstatistieken. U kunt de run in de gaten houden in NOS of in Local Run Manager.
Real-Time Analysis (RTA) software (Realtime analysesoftware) – RTA voert beeldanalyses en
u
basebepalingen, ook wel primaire analyse genoemd, uit tijdens de run. Raadpleeg
op pagina 58
voor meer informatie.
Benodigde schijfruimte
De in het instrument geïntegreerde computer heeft een opslagcapaciteit van ongeveer 1,5 TB.
Voor het starten van een run controleert de software de beschikbare schijfruimte. De benodigde schijfruimte
is afhankelijk van de analysemodule van Local Run Manager. Als er niet genoeg schijfruimte is voor de run,
verschijnt er een softwareprompt. Het bericht geeft aan hoeveel schijfruimte er nodig is voor de run en
hoeveel schijfruimte moet worden vrijgemaakt voordat de run verder kan gaan. Als er niet voldoende ruimte
is, verwijder dan de runmappen die niet opnieuw geanalyseerd hoeven te worden in Local Run Manager. Zie
Een runmap verwijderen op pagina 16
Documentnr. 1000000009513 v07 NLD
BESTEMD VOOR IN-VITRODIAGNOSTIEK
voor meer informatie.
voor meer informatie.
9
11
17
Realtime analyse
9