Gebruikershandleiding voor toepassing DRAGEN for Illumina DNA Prep with Enrichment Dx on NextSeq 550Dx
Kopregel
Beschrijving
ALT
De allelen die verschillen van de referentiebepaling. Bijvoorbeeld, een invoeging
van een enkele T wordt weergegeven als referentie A en alternatieve AT. Een A-
naar-T-variant van één nucleotide wordt weergegeven als referentie A en
alternatieve T.
QUAL
Een kwaliteitsscore op de Phred-schaal die is toegekend door de variantbepaler.
Hogere scores wijzen op een groter vertrouwen in de variant en een lagere
waarschijnlijkheid van aanwezige fouten. Voor een kwaliteitsscore van Q is de
geschatte kans op een fout 10-(Q/10). De reeks Q30-bepalingen heeft bijvoorbeeld
een foutenpercentage van 0,1%. Veel variantbepalers kennen kwaliteitsscores toe
op basis van hun statistische modellen, die hoog zijn in verhouding tot het
waargenomen foutenpercentage.
Documentnr. 200025238 v00
VOOR GEBRUIK BIJ IN-VITRODIAGNOSTIEK.
13