Inhoudsopgave
Advertenties
Gebruikershandleiding van het BD Viper™ LT-systeem
De op BD SDA- en PCR-gebaseerde assays zijn gebaseerd op de amplificatie en detectie van
doel-DNA met behulp van amplificatieprimers en een detectiesonde met een fluorescentie-etiket. De
SDA-priming- en amplificatiemicrowells of PCR-buisjes worden opgemaakt als afbreekstroken en
bevatten gedroogde reagentia. In SDA wordt het verwerkte monster toegevoegd aan de primingmicrowell
die de amplificatieprimers, de detectiesonde met fluorescentie-etiket en andere reagentia bevat die
nodig zijn voor de amplificatie. Na de incubatie wordt het reactiemengsel van de primingmicrowell
overgebracht naar de amplificatiemicrowell, die enzymen bevat (een DNA-polymerase en een
restrictie-endonuclease) die nodig zijn voor SDA. In PCR wordt het verwerkte monster toegevoegd
aan het PCR-buisje dat de amplificatieprimers, de detectiesonde met fluorescentie-etiket, door
verwarming geactiveerd enzym (Taq DNA-polymerase) en andere reagentia bevat die nodig zijn voor
PCR. De SDA-amplificatiemicrowells of PCR-buisjes worden afgedicht en vervolgens wordt de klep
van het afleesapparaat gesloten. De volgende amplificatie en detectie doen zich voor. De resultaten
worden automatisch gerapporteerd op basis van het algoritme dat in de assay-specifieke bijsluiter(s)
voor reagentia staat aangegeven.
Het instrument heeft twee gebruiksmodi. In de wegloopmodus laadt de gebruiker alle
verbruiksmaterialen en monsters op het instrument en keert terug wanneer de verwerking is voltooid.
In de hoge-doorvoermodus pauzeert het instrument nadat de monstervoorbereiding is voltooid en
voordat de amplificatie/detectie wordt gestart, zodat de verbruiksmaterialen voor de volgende
verwerking kunnen worden geladen. Terwijl de huidige verwerking wordt getest, kunnen in deze
modus de monsters voor de volgende verwerking worden voorbereid.
Wanneer de verwerking is voltooid, wordt er automatisch een resultatenrapport met daarin de
resultaten van alle geteste monsters afgedrukt.
1.3
Overzicht van het instrument
1.3.1 BD Viper™ LT-instrument
Het BD Viper™ LT-instrument bevat de volgende modules: een subsysteem voor temperatuurcontrole/
verwarming om de temperaturen van de verwarmers te regelen; een robotpipetteerarm om monsters
over te brengen, puncties en de amplificatie-/PCR-schaal af te dichten; een extractor die op chemische
wijze DNA uit monsters haalt; een LCD-kleurenmonitor (Liquid Crystal Display) met aanraakscherm;
een ingebouwd afleesapparaat om de amplificatiereactie te meten en de resultaten te rapporteren; en
de hoofdcomputer die zorgt voor de controle van het instrument, de zelfkalibratie en de
gebruikersinterface. De voornaamste componenten worden weergegeven in afbeelding 1-1 en 1-2 en
omvatten het volgende:
Het systeem voor vloeistofverwerking
De robot brengt alle monsters over. De robot is voorzien van een pipettor met vier stations voor het
overbrengen van vloeistof tussen monsterbuisjes, extractiebuisjes, reagensbak, priming- en
amplificatiemicrowells voor SDA-assays, en PCR-buisjes. Behalve dat er door de robot vloeistof
wordt overgebracht, gebruikt de robot ook een prikker voor toegang tot de extractiereagensbak en
hulpmiddelen voor het afdichten van schalen om de amplificatieschaal af te dichten. In de
ruststand bevindt de robotarm zich helemaal rechts van de binnenkant van het instrument.
Extractor
Monsterlysis en DNA-extractie vinden plaats in de extractormodule rechtsvoor van het
instrumentenplatform. De extractor bestaat uit 6 rijen (nummers) en 8 kolommen (letters) waarin
48 extractiebuisjes kunnen worden geplaatst. Tussen de buisjes gaan magneten omhoog en
omlaag. DNA dat is gebonden aan ijzeroxide in de extractiebuisjes, wordt door de magneten naar
de zijkant van het buisje getrokken als het monsterafval wordt verwijderd en afgevoerd door de
pipettor. Van daaruit wordt het DNA uit de extractiebuisjes verwijderd en overgebracht naar
primingmicrowells voor SDA-assays of naar PCR-buisjes voor PCR-assays.
8
Advertenties
Inhoudsopgave
