Download Inhoudsopgave Inhoud
Deel
Print deze pagina
  1. Handleidingen
  2. Merken
  3. nanoString Handleidingen
  4. Analytische instrumenten
  5. nCounter
  6. Gebruikershandleiding

nanoString nCounter Gebruikershandleiding

Verberg thumbnails
Inhoudsopgave

Advertenties

Quick Links

Download deze handleiding
nCounter
®
Gebruikershandleiding Dx-analysesysteem
NanoString Technologies
530 Fairview Ave N
Seattle, WA 98109 V.S.
www.nanostring.com
Telefoon:
+1 206.378.6266
+1 888.358.NANO
E-mail:
dxsupport@nanostring.com
Voor in vitro diagnostisch gebruik
Het nCounter Dx-analysesysteem dat onderwerp is van deze handleiding, is bestemd voor gebruik met de diagnostische analyses van NanoString, binnen
hun beoogde gebruik in de EU, Verenigde Staten en andere toepasselijke markten.
®
, Inc.
2017-07 MAN-10011-06

Advertenties

Inhoudsopgave
loading

Samenvatting van Inhoud voor nanoString nCounter

  • Pagina 1 Voor in vitro diagnostisch gebruik Het nCounter Dx-analysesysteem dat onderwerp is van deze handleiding, is bestemd voor gebruik met de diagnostische analyses van NanoString, binnen hun beoogde gebruik in de EU, Verenigde Staten en andere toepasselijke markten. 2017-07 MAN-10011-06...

  • Pagina 2: Intellectuele Eigendomsrechten

    De productie, het gebruik en/of de verkoop van NanoString-product(en) kan aan één of meer octrooien of octrooiaanvragen zijn onderworpen die eigendom zijn van NanoString of gelicentieerd zijn aan NanoString van Life Technologies Corporation en andere derde partijen. Ga voor een lijst met alle toepasselijke patenten naar www.nanostring.com/company/patents.

  • Pagina 3: Contactinformatie

    NanoString Technologies ® GEBRUIKERSHANDLEIDING Contactinformatie NanoString Technologies, Inc. 530 Fairview Ave N Seattle, WA 98109 Telefoon: +1.888.358.NANO (+1.888.358.6266) Fax: +1.206.378.6288 E-mail: dxsupport@nanostring.com Website: www.nanostring.com EC REP Bevoegde vertegenwoordiger in EU Emergo Europe Prinsessegracht 20 2514 AP, Den Haag Nederland E-mail: dxsupport@nanostring.com...

  • Pagina 4: Inhoudsopgave

    GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter ® Dx-analysesysteem Inhoud 1 Inleiding ....................7 A.
  • Pagina 5 NanoString Technologies ® GEBRUIKERSHANDLEIDING 4 De webapplicatie bedienen ............... 20 A.
  • Pagina 6 GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter ® Dx-analysesysteem 5 Het Prep Station bedienen ............... . 67 A.

  • Pagina 7: Inleiding

    Inleiding A. Gebruiksbeperkingen van product Het nCounter Dx-analysesysteem en het nCounter Dx-analysesysteem met de FLEX-configuratie (wanneer in IVD-modus gebruikt) is bedoeld voor in vitro diagnostisch gebruik wanneer samen gebruikt met specifieke IVD goedgekeurde bepaling die het gebruik ervan vermeld. Het nCounter Dx-analysesysteem mag alleen met nCounter-testkits van NanoString worden gebruikt.

  • Pagina 8: Conventies Handleiding

    GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter ® Dx-analysesysteem D. Conventies handleiding De volgende conventies worden in deze handleiding gebruikt en worden voor uw referentie beschreven. Tekststijl Betekenis Vetgedrukt Vetgedrukte tekst wordt meestal gebruikt om een specifieke knop, toetsaanslag of menu-optie te markeren. Vetgedrukte tekst kan ergens anders verschijnen om belangrijke tekst of termen te markeren.

  • Pagina 9: Aanvullende Voorzorgsmaatregelen

    • Zorg dat alle verbruiksmateriaal goed in het systeem is geplaatst voordat u een procedure start. • Bedien het systeem alleen met gebruik van de nCounter-testkits van NanoString, volgens hun bedoelde gebruik. • Draag handschoenen tijdens het bedienen of uitvoeren van onderhoudswerkzaamheden aan de instrumenten.

  • Pagina 10: Overzicht Hardware

    ® GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter Dx-analysesysteem Overzicht hardware A. Algemene informatie Het serienummer en de nalevingsinformatie van het instrument kunnen op het achterpaneel van elk instrument op het typeplaatje worden gevonden. Controleer of het typeplaatje en de conformiteitsverklaring (alleen EU) betreffende nalevingsinformatie.

  • Pagina 11: Prep Station

    GEBRUIKERSHANDLEIDING B. Prep Station Het Prep Station is een pipetteringsrobot met meerdere kanalen die specifiek is geconfigureerd voor gebruik met de nCounter-testkits van NanoString. Het instrument voert vloeistofoverdracht, magnetische korrelscheiding en immobilisatie van moleculaire labels op het oppervlak van het monsterpatroon uit (AFBEELDING 2.1).

  • Pagina 12: Digital Analyzer

    ® Dx-analysesysteem C. Digital Analyzer De Digital Analyzer is een epifluorescentie-scanner met meerdere kanalen die specifiek is geconfigureerd voor gebruik met de nCounter- testkitpatronen van NanoString. In het instrument kunnen tot zes patronen worden geladen (AFBEELDING 2.3). Als één of meer scans zijn voltooid, kan het instrument worden gepauzeerd om nieuwe patronen te wisselen zonder de resterende patronen te verstoren.

  • Pagina 13: De Instrumentmodus Selecteren

    Voor alle andere toepassingen moeten personen die nCounter CodeSets of nCounter Elements gebruiken, de Life Sciences-modus selecteren en de gebruikershandleiding van het nCounter-analysesysteem raadplegen voor meer instructies.

  • Pagina 14: Prep Station

    AFBEELDING 3.1: Het scherm ‘Select Instrument Mode’ (Instrumentmodus selecteren) van het Prep Station Druk op het blauwe pictogram met het label NanoString® Diagnostics om naar de diagnostische modus te gaan. Het systeem zal de toepassing laden en het welkomstscherm tonen (AFBEELDING 3.2).
  • Pagina 15 NanoString Technologies ® GEBRUIKERSHANDLEIDING Voer een geldige gebruikersnaam en geldig wachtwoord in en druk op de knop Sign in (Aanmelden). AFBEELDING 3.3: Het aanmeldscherm >>> Het Hoofdmenu verschijnt (AFBEELDING 3.4) AFBEELDING 3.4: Het hoofdmenu van het Prep Station in diagnostische modus...

  • Pagina 16: Instrumentmodus Wisselen

    GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter ® Dx-analysesysteem Instrumentmodus wisselen De gebruiker kan vanuit het hoofdmenu tussen de diagnostische modus en de Life Sciences-modus wisselen. Druk op de knop Exit (Afsluiten) onderaan het hoofdmenu (AFBEELDING 3.4). >>> Het bevestigingsscherm ‘Exit Diagnostics Mode‘ (Diagnostische modus afsluiten) verschijnt.

  • Pagina 17: Digital Analyzer

    AFBEELDING 3.6: Het scherm ‘Select Instrument Mode ‘ (Instrumentmodus selecteren) van de Digital Analyzer Druk op het blauwe pictogram met het label NanoString® Diagnostics om naar de diagnostische modus te gaan. Het systeem zal de toepassing laden en het welkomstscherm tonen (AFBEELDING 3.7).
  • Pagina 18 GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter ® Dx-analysesysteem Voer een geldige gebruikersnaam en geldig wachtwoord in en druk op de knop Sign in (Aanmelden). AFBEELDING 3.8: Het aanmeldscherm >>> Het Hoofdmenu verschijnt (AFBEELDING 3.9) AFBEELDING 3.9: Het hoofdmenu van de Digital Analyzer in diagnostische modus...

  • Pagina 19: Instrumentmodus Wisselen

    NanoString Technologies ® GEBRUIKERSHANDLEIDING Instrumentmodus wisselen De gebruiker kan vanuit het hoofdmenu tussen de diagnostische modus en de Life Sciences-modus wisselen. Druk op de knop Exit (Afsluiten) onderaan het hoofdmenu (AFBEELDING 3.9). >>> Het bevestigingsscherm ‘Exit Diagnostics Mode‘ (Diagnostische modus afsluiten) verschijnt.

  • Pagina 20: De Webapplicatie Bedienen

    De webapplicatie bedienen Dit hoofdstuk biedt richtlijnen voor gebruik van de nCounter-webapplicatie die zich op een server in de nCounter Digital Analyzer bevindt. Als het systeem op een netwerk wordt aangesloten, kan de webapplicatie worden gebruikt om met zowel het Prep Station als de Digital Analyzer te communiceren.

  • Pagina 21: Gebruikers-Id/Wachtwoord Vergeten

    Het Analysetype bedieningselement op de Sign In (aanmeld) pagina gebruikers-id/wachtwoord vergeten • Als u uw gebruikers-id bent vergeten, moet contact worden opgenomen met de plaatselijke nCounter-systeembeheerder om hem terug te krijgen. • Als het wachtwoord is vergeten, kan de nCounter-webapplicatie het mogelijk ophalen.
  • Pagina 22 ® Dx-analysesysteem • Voer uw gebruikers-id in. • Als het nCounter-systeem een overeenkomend profiel vindt, wordt het wachtwoord per e-mail verzonden naar het opgeslagen adres (AFBEELDING 4.4). • Als geen overeenkomend profiel wordt gevonden, wordt u geïnstrueerd contact op te nemen met de nCounter-systeembeheerder om het wachtwoord opnieuw in te stellen.

  • Pagina 23: Mijn Profiel Bijwerken

    NanoString Technologies ® GEBRUIKERSHANDLEIDING Mijn profiel bijwerken Gebruikersinformatie kan worden bijgewerkt door van de menubalk bovenin de pagina de knop My Profile (Mijn profiel) te selecteren (AFBEELDING 4.5). AFBEELDING 4.5: Locatie van de knop My Profile (Mijn profiel) Met de pagina ‘My Profile’ (Mijn profiel) kan de gebruiker het wachtwoord van de account en/of het e-mailadres veranderen dat aan het...

  • Pagina 24: Opmaak Toepassing En Navigatie

    ® Dx-analysesysteem B. Opmaak toepassing en navigatie Menu De nCounter-webapplicatie heeft bovenin een menubalk waarmee gebruikers snel van een gebied van de applicatie naar een ander gebied kunnen navigeren (AFBEELDING 4.7). De menu-items verdelen de applicatie in vijf onderdelen: • Dashboard – Algemene taken en statussen van recente activiteiten •...

  • Pagina 25: Tabellen

    Filter Tabellen kunnen bij regelmatig gebruik van de nCounter-webapplicatie groter worden, waardoor het moeilijk kan worden om gegevens te vinden waarin men geïnteresseerd is. In alle tabellen is filteren beschikbaar waarmee gebruikers alleen gegevens kunnen zoeken en weergeven waarin zij geïnteresseerd zijn.
  • Pagina 26 GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter ® Dx-analysesysteem AFBEELDING 4.10: Een voorbeeld van filterinstellingen op de pagina ‘Run Sets’ (Uitvoeringssets) Klik op Apply (Toepassen) als u klaar bent. In de tabel worden alleen relevante rijen weergegeven (AFBEELDING 4.11). OPMERKING: De aan- of afwezigheid van een trechterpictogram naast de paginatitel, geeft aan of de filter wel of niet is toegepast.

  • Pagina 27: Sorteren

    NanoString Technologies ® GEBRUIKERSHANDLEIDING Sorteren Met alle tabelkolommen kunnen gebruikers de weergegeven rijen in oplopende of aflopende volgorde sorteren. Klik op de koptekst van de kolom met de gewenste gegevens om de rijen te sorteren (AFBEELDING 4.13). Om de gegevens opnieuw in omgekeerde volgorde te sorteren, klikt u opnieuw op dezelfde koptekst van de kolom.

  • Pagina 28: Formulieren

    GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter ® Dx-analysesysteem Formulieren Formulieren zijn pagina’s voor handmatige wijzigingen van gegevensinvoer. Gebruikers met de account-machtiging ‘Create Run Set’ (Uitvoeringsset maken) hebben toegang tot de formulieren ‘Create Run Set’ (Uitvoeringsset maken) en ‘Edit Run Set’ (Uitvoeringsset bewerken). Gebruikers zonder deze machtiging kunnen Run Sets (Uitvoeringsset) en monsterstatussen bekijken, maar zij kunnen geen uitvoeringssets maken of bewerken.

  • Pagina 29: Pagina's Dashboard En Status

    C. Pagina’s Dashboard en Status Dashboard Het Dashboard is de landingspagina, het eerste scherm dat wordt weergegeven na aanmelding in de nCounter-webapplicatie (AFBEELDING 4.15). Het Dashboard kan vanuit andere pagina’s worden geopend door op het menu-item Dashboard te klikken. Tijdens bewerking van een formulier is het echter niet beschikbaar totdat het formulier is opgeslagen of verwijderd.

  • Pagina 30: Uitvoeringssetstatus

    GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter ® Dx-analysesysteem Uitvoeringssetstatus De pagina ‘Run Sets’ (Uitvoeringssets) kan vanaf het dashboard worden geopend, zoals hierboven wordt beschreven. Het is ook beschikbaar door op de menubalk op Runs (Uitvoeringen) te klikken. De pagina ‘Uitvoeringssets’ geeft de statussen weer van alle uitvoeringssets die zijn gemaakt (AFBEELDING 4.16).
  • Pagina 31 NanoString Technologies ® GEBRUIKERSHANDLEIDING De volgende informatie is beschikbaar: Run Set ID (Uitvoeringsset-id) – Het uitvoeringsset-id dat is ingevoerd toen de uitvoeringsset werd gemaakt Status – De huidige conditie of status van de uitvoeringsset. Mogelijke statussen omvatten: • BatchRegistered – Uitvoeringsset geregistreerd (uitvoeringsset is gedefinieerd maar verwerking is nog niet gestart) •...

  • Pagina 32: Monsterstatus

    GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter ® Dx-analysesysteem Monsterstatus Net als de pagina ‘Run Sets’ (Uitvoeringssets) kan de pagina ‘Samples’ (Monsters) vanaf het dashboard worden geopend. Hij is ook beschikbaar vanuit de menu-optie Samples (Monsters) bovenin de pagina (AFBEELDING 4.17). AFBEELDING 4.17: De locatie van de menu-optie ‘Samples’ (Monsters) Met de pagina ‘Samples’...
  • Pagina 33 NanoString Technologies ® GEBRUIKERSHANDLEIDING De volgende informatie is beschikbaar: Sample ID (Monster-id) – Het monster-id is handmatig ingevoerd of via een streepjescodescanner tijdens de aanmaak van de uitvoeringsset Run Set ID (Uitvoeringsset-id) – Het uitvoeringsset-id ingevoerd toen de uitvoeringsset in de webapplicatie werd gemaakt Status –...

  • Pagina 34: Uitvoeringssets

    Dit hoofdstuk leidt gebruikers door het maken, bewerken, afdrukken en verwijderen van Uitvoeringssets. Een uitvoeringsset maken Gebruikers moeten een uitvoeringsset maken, waarbij de monster-id’s aan de putlocaties van hun stripbuisjes zijn gekoppeld via de nCounter- webapplicatie. Een gebruiker kan ervoor kiezen om vanuit diverse plaatsen in de toepassing een nieuwe uitvoeringsset te maken. De meest gebruikelijke...
  • Pagina 35 ® GEBRUIKERSHANDLEIDING Voer de volgende informatie in om een uitvoeringsset te maken: nCounter analysetype –Indien de gebruiker toegang heeft tot meer dan één nCounter analysetype, wordt de analyse die eerder tijdens het aanmelden werd geselecteerd weergegeven (AFBEELDING 4.2). Om deze selectie te wijzigen, moet u zich afmelden en opnieuw aanmelden terwijl u een ander analysetype selecteert.
  • Pagina 36 GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter ® Dx-analysesysteem AFBEELDING 4.21: De locatie van de contactpersonenlijst en e-mailberichten op het formulier ‘Create New Run Set’ (Nieuwe uitvoeringsset maken). Het is van cruciaal belang om de monstergegevens correct in te voeren. Vul voor elk putje met de gevraagde informatie voordat u de monstergegevens voor het volgende putje invoert.
  • Pagina 37 NanoString Technologies ® GEBRUIKERSHANDLEIDING >>> Het werkblad verschijnt in een nieuw venster (AFBEELDING 4.23). AFBEELDING 4.23: Voorbeeld van een werkblad Selecteer Print (Afdrukken) om het werkblad af te drukken en sluit daarna het werkblad. De toepassing gaat terug naar de pagina ‘Run Sets’...

  • Pagina 38: Een Uitvoeringsset Bewerken

    GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter ® Dx-analysesysteem Een uitvoeringsset bewerken Uitvoeringsset met de status ‘BatchRegistered’ kunnen worden bewerkt. Gebruikers moeten een uitvoeringsset bewerken zodat hij overeenkomt met het hybridisatie-eindrapport als monsterinformatie is gewijzigd. De monster-id-labels kunnen bijvoorbeeld worden bijgewerkt als patiëntmonsters worden uitgewisseld of als een nieuwe monster-id wordt toegewezen.

  • Pagina 39: Een Uitvoeringsset Verwijderen

    NanoString Technologies ® GEBRUIKERSHANDLEIDING Een uitvoeringsset verwijderen Uitvoeringssets met de status ‘BatchRegistered’ kunnen, indien nodig, worden verwijderd. Om een uitvoeringsset te verwijderen, selecteert u de juiste uitvoeringsset in de lijst en klikt u op de knop Delete (Verwijderen) (AFBEELDING 4.26).

  • Pagina 40: Werkbladen Afdrukken

    Het is echter ook mogelijk om op elk willekeurig moment vanaf de nCounter-webapplicatie werkbladen van de uitvoeringssets af te drukken. Om een werkblad van een uitvoeringsset af te drukken, navigeert u naar de pagina ‘Run Set’ (Uitvoeringssets), selecteert u de rij van de...

  • Pagina 41: Rapporten

    OPMERKING: De download-koppeling vereist dat de gebruiker zich aanmeldt in de nCounter-webapplicatie voordat de diagnostische rapporten kunnen worden geopend. Selecteer vanaf de pagina Rapporten de te downloaden rij(en) van de monsters en klik op de knop Download (AFBEELDING 4.30).

  • Pagina 42: Beheer

    GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter ® Dx-analysesysteem G. Beheer Voor beheerders, is in de bovenste menubalk van de webapplicatie de knop Admin (Beheer) beschikbaar. Beheerders kunnen deze functies kiezen: • Manage Users (Gebruikers beheren) • System Settings (Systeeminstellingen) • Add User (Gebruiker toevoegen) •...

  • Pagina 43: Gebruikers Toevoegen, Verwijderen En Beheren

    NanoString Technologies ® GEBRUIKERSHANDLEIDING Gebruikers toevoegen, verwijderen en beheren Selecteer van de bovenste menubalk Admin (Beheer) en klik op Add User (Gebruiker toevoegen) om een nieuwe gebruiker toe te voegen (AFBEELDING 4.31). AFBEELDING 4.31: De locatie van de knop Add User (Gebruiker toevoegen) in het submenu Admin (Beheer) >>>...
  • Pagina 44 GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter ® Dx-analysesysteem Voer de volgende informatie in en klik op de knop Save (Opslaan). • User ID (Gebruikers-id) (verplicht) • Password (Wachtwoord) (verplicht) • Confirm Password (Wachtwoord bevestigen) (verplicht) • Email address (E-mailadres) (verplicht) • User Type (Gebruikerstype) (verplicht) – kies een van het volgende: •...

  • Pagina 45: E-Mailadres

    NanoString Technologies ® GEBRUIKERSHANDLEIDING Selecteer de koppeling User ID (gebruikers-id) of selecteer de rij voor de aangegeven gebruiker en klik op de knop Edit (Bewerken) om een gebruiker te bewerken. >>> Het formulier ‘Gebruikersgegevens bewerken’ verschijnt (AFBEELDING 4.34). AFBEELDING 4.34: Het formulier ‘Edit User Data’...
  • Pagina 46 GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter ® Dx-analysesysteem Open de pagina ‘Manage Users’ (Gebruikers beheren), selecteer de rij voor de juiste gebruiker en klik op de knop Delete (Verwijderen) om een gebruiker te verwijderen (AFBEELDING 4.35). AFBEELDING 4.35: Locatie van de knop Delete (Verwijderen) op de pagina ‘Gebruikers beheren’...

  • Pagina 47: System Settings (Systeeminstellingen)

    NanoString Technologies ® GEBRUIKERSHANDLEIDING System Settings (Systeeminstellingen) Systeeminstellingen zijn beschikbaar voor gebruikers met het gebruikerstype Beheer. De pagina Systeeminstellingen ondersteunt vier belangrijke functies, die in separate tabbladen worden weergegeven: • Date and Time (datum en tijd) (standaard tabblad) • E-mailadresinstellingen •...

  • Pagina 48: Datum En Tijd

    Datum en tijd De instellingen voor datum en tijd worden aanvankelijk ingesteld als NanoString-personeel de nCounter instellen. Wijzig deze instellingen alleen wanneer nodig. Klik op Save (Opslaan) om eventuele wijzigingen op te slaan of klik op Cancel (Annuleren) om wijzigingen te negeren en een andere functie uit te voeren.

  • Pagina 49: E-Mailadresinstellingen

    GEBRUIKERSHANDLEIDING E-mailadresinstellingen E-mailinstellingen (AFBEELDING 4.39) moeten worden geconfigureerd zodat het nCounter-systeem succesvol automatische e-mails kan verzenden voor statusupdates, zoals voltooiing van uitvoering van het Prep Station of diagnostische rapportnotificaties. AFBEELDING 4.39: Het tabblad E-mail Settings (E-mailinstellingen) De volgende velden zijn beschikbaar: •...

  • Pagina 50: Ssh-Instellingen

    4.40) kan een beheerder de Secure Shell Server (SSH-server) configureren. Met de SSH-server kunnen gebruikers op programmeerbare veilige wijze nCounter-rapportgegevens of backupgegevens van het systeem afhalen. Hij staat ook onbeperkte concurrerende client-verbindingen toe. Zie het hoofdstuk ‘LIS integration’ (LIS-integratie) hieronder voor meer informatie.
  • Pagina 51 NanoString Technologies ® GEBRUIKERSHANDLEIDING Zodra het Enable SSH Server is ingeschakeld, kan de beheerder selecteren welk type analyse of backupgeggevens voor SSH-toegang geconfigureerd dienen te worden (AFBEELDING 4.41). AFBEELDING 4.41: Het menu Assay / Backup (Analyse/Backup) is actief nadat het selectievakje Enable SSH Server (SSH-server...
  • Pagina 52 4.42) is een belangrijke functie om netwerken van de instrumenten in te schakelen. Het Prep Station, de Digital Analyzer en nCounter-webapplicatie hebben regelmatige communicatie. Het IP-adres is de basis om deze communicatie op te stellen. Kijk uit als u veranderingen aanbrengt aan de velden van het tabblad IP Address (IP-adressen).

  • Pagina 53: Configure Report (Rapport Configureren)

    Beheerders kunnen statische tekst opnemen en bepaalde, door het systeem geleverde informatie over het monster, toevoegen. Monsterparameters in de koptekst van het standaard diagnostische rapport van NanoString kunnen in standaard kop- en voetteksten worden toegevoegd. Verder kunnen beheerders velden opnemen die in de uitgaande PDF worden voltooid nadat ze zijn gedownload van het nCounter Dx-analysesysteem.
  • Pagina 54 GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter ® Dx-analysesysteem De pagina ‘Configure Report’ (Rapport configureren) wordt weergegeven, open het standaard tabblad General (Algemeen) (AFBEELDING 4.44). AFBEELDING 4.44: Het tabblad General (Algemeen) van de pagina Configure Report (Rapport configureren) (Inhoud van rapport varieert door reglementair verwijderen van goedkeuringen) Binnen het gedeelte Configure Report (Rapport configureren) zijn de volgende tabbladen beschikbaar: •...
  • Pagina 55 Conceptversies kunnen gestart worden vanuit het huidige productierapport, de NanoString standaardkoptekst en -voettekst, lege koptekst en voettekst of een van de vele beschikbare sjablonen. Deze sjablonen moeten verder aangepast worden door beheerders om aan de vereisten van hun organisaties te voldoen.
  • Pagina 56 NanoString geleverde hoofdgedeelte. De knop Preview (Voorbeeld) kan altijd worden gebruikt om een PDF te genereren met de onlangs ingevoerde koptekstvelden.
  • Pagina 57 • Run Date (Uitvoerdatum) – de datum dat het monster op de DA is uitgevoerd. Deze datum wordt automatisch opgeslagen door het nCounter Dx-analysesysteem. • Comments (Opmerkingen) – de memo die ingevoerd wordt met het monster op de pagina Create New Run Set (Nieuwe uitvoeringsset maken).

  • Pagina 58: Tabblad Signature (Handtekening)

    De beschikbare opmaakfuncties voor de koptekst zijn ook beschikbaar voor de voettekst. AFBEELDING 4.50: Een voorbeeld van de standaard NanoString-voettekst Tabblad Signature (Handtekening) Op het tabblad Signature (Handtekening) kan een beheerder een handtekeningregel toevoegen op de laatste pagina van het rapport (AFBEELDING 4.51).

  • Pagina 59: Voorbeeld Koptekstconfiguratie

    NanoString Technologies ® GEBRUIKERSHANDLEIDING Voorbeeld koptekstconfiguratie Om verder te illustreren hoe de koptekst geconfigureerd kan worden, kunt u aan een laboratorium denken met een standaardkoptekst die bestaat uit het logo van de organisatie; achternaam, voornaam, geboortedatum en geslacht van patiënt; en analysespecifieke velden.
  • Pagina 60 GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter ® Dx-analysesysteem 13. Klik met de rechtermuisknop op het logo en selecteer Merge Down (Omlaag samenvoegen) in het weergegeven menu. De bovenste 2 cellen van de meest linkse kolom van de tabel worden samengevoegd. Herhaal dit tot er 1 cel over is in de meest linkse kolom van de tabel.

  • Pagina 61: Rapportintegratie Met Externe Systemen

    PDF-bestand dat identiek is aan het bestand dat gedownload kan worden via de web GUI als een PDF van het NanoString-standaardrapport (indien anders dan het huidige rapport), en als een modulaire set grafische bestanden die opgenomen kunnen worden in downstream systeemuitvoer.

  • Pagina 62: Bestandsnamen

    GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter ® Dx-analysesysteem Bestandsnamen Alle indelingen hebben een algemene basisnaam: <YYMMDD>_<cartridgeID>_<scan>_<sampleName>_<Lane> Waar: <YYMMDD> Laatste 2 cijfers van het jaar, maand weergegeven met 2 cijfers, dag weergegeven met 2 cijfers <cartridgeID> Streepjescode op het patroon <scan> Door het systeem toegewezen. Vaak standaard ingesteld op 1 <sampleName>...

  • Pagina 63: Analyserapport (Xml) Bestanden

    De informatie in deze bestanden is uniek voor iedere analyse. Organisaties en individuen die deze export gebruiken dxsupport@nanostring.com moeten contact opnemen met NanoString via voor analysespecifieke documentatie en om ervoor te zorgen dat alle toepasselijke richtlijnen worden gevolgd.
  • Pagina 64 GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter ® Dx-analysesysteem Klik op de knop Edit Sample (Monster bewerken). >>> De pagina Monster bewerken verschijnt (AFBEELDING 4.54). AFBEELDING 4.54: Pagina Edit Sample (Monster bewerken) De velden voor monsterparameters (# of Positive Nodes (Aantal positieve klieren) en Tumor Size (Tumorgrootte) in dit voorbeeld) en Memo (voor het toevoegen van opmerkingen, indien gewenst) kunnen worden bijgewerkt.
  • Pagina 65 NanoString Technologies ® GEBRUIKERSHANDLEIDING Zorg ervoor dat het juiste monster wordt bewerkt en dat de bijgewerkte velden correct zijn. Als er een verantwoording is ingevoerd, klikt u op de knop Revise Sample (Monster bijwerken). Er wordt een laatste bevestiging weergegeven van de bewerking (AFBEELDING 4.55).

  • Pagina 66: System Backup Archive (Systeembackup-Archief)

    SSH-serverfunctie van nCounter. In het onwaarschijnlijke geval dat de Digital Analyzer van nCounter een storing heeft of systeemherstel vereist, kunnen erkende NanoString- servicemonteurs het back-up-archief gebruiken - indien buiten het instrument opgeslagen door de klant - om de systeemconfiguratie en analysegegevens te herstellen.

  • Pagina 67: Het Prep Station Bedienen

    ® NanoString Technologies GEBRUIKERSHANDLEIDING Het Prep Station bedienen A. Vóór het starten van een uitvoering Afvalverwijdering Zorg voor het starten van een nieuwe uitvoering, dat de afvalbakken leeg zijn. Voor elke uitvoering zijn lege afvalbakken vereist. VOORZICHTIG: Als afvalbakken niet leeg zijn, kunnen punten in contact komen met afvalvloeistoffen en monsters bevuilen of overmatige punten kunnen opstapelen en een systeemstoring veroorzaken.

  • Pagina 68: Een Uitvoering Starten

    GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter ® Dx-analysesysteem B. Een uitvoering starten De volgende stappen vatten de werkstroom samen die vanaf het welkomstscherm op het aanraakscherm van het Prep Station start. Om met het Prep Station monsters te verwerken, moet een gebruiker zich op het instrument aanmelden. Selecteer de knop Main Menu (Hoofdmenu) op het welkomstscherm om u aan te melden.
  • Pagina 69 OPMERKING: De knop Exit (Afsluiten) verschijnt alleen op het welkomstscherm en het hoofdmenu als de gebruiker het nCounter Dx-analysesysteem met FLEX-configuratie heeft (zie Hoofdstuk 3 – De instrumentmodus selecteren). 2017-07 MAN-10011-06...
  • Pagina 70 GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter ® Dx-analysesysteem Selecteer de te verwerken uitvoeringsset door de naam van de uitvoeringsset aan te raken. Gebruik de pijltoetsen op de rechterkant van het scherm om door de selecties te bladeren. Klik op Next (Volgende) om door te gaan.
  • Pagina 71 Voordat u doorgaat, moeten de patronen en reagensplaten (AFBEELDING 5.8) op kamertemperatuur zijn. Verwijder de nCounter-reagensplaten uit de opslag op 4°C en de nCounter-patronen van de opslag op -20°C. Laat ze gedurende 10-15 minuten op kamertemperatuur komen. AFBEELDING 5.8: EEN...
  • Pagina 72 GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter ® Dx-analysesysteem Centrifugeer de reagensplaten gedurende 2 minuten op 2000 x g om op de bodem van de putjes vloeistoffen te verzamelen voordat u de reagensplaten op de tafel van het Prep Station plaatst. Ga door met het opstellen van het Prep Station terwijl de patronen en platen op kamertemperatuur komen. Tik op Next (Volgende).
  • Pagina 73 NanoString Technologies ® GEBRUIKERSHANDLEIDING Instructies voor het scherm ‘Reagensplaat’: Voordat u doorgaat, moet u de streepjescode voor de reagensplaten scannen. Houd de streepjescode voor de streepjescodelezer. Er verschijnt een rode straal. Beweeg de streepjescode voor de rode straal totdat hij is opgenomen. Als de streepjescode succesvol is opgenomen, verschijnt het nummer van de streepjescode in het vak en verandert de knop Manual Entry (Handmatige invoer) naar Clear Entry (Invoering wissen).
  • Pagina 74 GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter ® Dx-analysesysteem Druk op Next (Volgende). >>> Het scherm ‘Tips and Foil Piercers’ (Punten en folieprikkers) verschijnt (AFBEELDING 5.12). AFBEELDING 5.12: Het scherm ‘Tips And Foil Piercers’ (Punten en folieprikkers) 10. Instructies voor het scherm ‘Tips and Foil Piercers’ (Punten en folieprikkers): Verwijder de metalen punthouder van de tafel van het Prep Station door het rechtop op te tillen.
  • Pagina 75 NanoString Technologies ® GEBRUIKERSHANDLEIDING Plaats de geladen metalen punthouder terug op de tafel van het Prep Station, met de folieprikkers het dichtst bij de voorkant van de tafel (AFBEELDING 5.14). AFBEELDING 5.14: Juiste plaatsing van rek met pipetpunten en folieprikkers.
  • Pagina 76 GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter ® Dx-analysesysteem 11. Plaats de puntschachten op de tafel en druk ze stevig op hun plaats. Tik op Next (Volgende). >>> Het scherm ‘Empty Strip Tubes’ (Lege strookbuisjes) verschijnt (AFBEELDING 5.16). AFBEELDING 5.16: Het scherm ‘Empty Strip Tubes’ (Lege strookbuisjes) 12.
  • Pagina 77 NanoString Technologies ® GEBRUIKERSHANDLEIDING 13. Instructies voor het scherm ‘Monsterpatroon’: Voordat u doorgaat, moet u de streepjescode voor het monsterpatroon scannen. Houd de streepjescode voor de streepjescodelezer. Er verschijnt een rode straal. Verplaats de streepjescode voor de rode straal totdat hij is gescand en het nummer van de streepjescode in het invoerveld verschijnt.
  • Pagina 78 GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter ® Dx-analysesysteem 14. Laat de elektrodebehuizing voorzichtig op de plaats over het patroon zakken (AFBEELDING 5.20). De 24 elektroden moeten gemakkelijk in de 24 putjes worden geplaatst. Tik op Next (Volgende). AFBEELDING 5.20: Laat de elektrodebehuizing voorzichtig op de plaats over het patroon zakken.
  • Pagina 79 Zorg dat alle dopjes van de buisjes met de gehybridiseerde monsters zijn verwijderd voordat u de buisjes op de tafel plaatst. De dopjes erop laten, resulteert in een pauze in het protocol en vereist interventie door de gebruiker. BELANGRIJK: Gebruik alleen door NanoString geleverde strookbuisjes. Andere buisjes hebben mogelijk andere afmetingen en veroorzaken systeemstoringen. 2017-07 MAN-10011-06...
  • Pagina 80 GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter ® Dx-analysesysteem Sluit het deksel dat over de buisjes valt stevig (AFBEELDING 5.23). AFBEELDING 5.23: Deksel gesloten over buisjes Druk op Next (Volgende). BELANGRIJK: Het niet stevig dichtklemmen van het deksel over de buisjes kan in een systeemstoring resulteren. Als het metalen deksel niet helemaal is gesloten, retourneert de sensor een foutbericht en kan de uitvoering niet worden gestart totdat de fout is gecorrigeerd.
  • Pagina 81 NanoString Technologies ® GEBRUIKERSHANDLEIDING >>> Het scherm ‘Notification Options’ (Opties melding) verschijnt (AFBEELDING 5.24). AFBEELDING 5.24: Het scherm ‘Notification Options’ (Opties melding) 16. Selecteer of het Prep Station een hoorbaar alarm moet laten afgaan als de verwerking is voltooid. Tik op Next (Volgende).
  • Pagina 82 ® Dx-analysesysteem Het nCounter-Prep Station kan nu controleren of alle verbruiksmaterialen en reagentia juist op de tafel zijn geplaatst (AFBEELDING 5.26). Hiervoor bevestigt het Prep Station dat de sensoren voor het monsterpatroon, de elektrodebehuizing en verwarmingsklep in de juiste staat verkeren. De pipetkop controleert dan of de punten, puntschachten, strookbuisjes en reagensplaten op de plaats zijn door ze met een reeks validatiepunten aan te raken.
  • Pagina 83 NanoString Technologies ® GEBRUIKERSHANDLEIDING 17. Als de monsterverwerking is voltooid, verschijnt het blauwe scherm en start de timer te tellen vanaf het moment dat de uitvoering werd voltooid (AFBEELDING 5.28). Tik op Next (Volgende). AFBEELDING 5.28: Het scherm ‘System Processing Complete’ (Systeemverwerking voltooid) 18.
  • Pagina 84 GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter ® Dx-analysesysteem 19. Om na voltooiing van de uitvoering de behuizing los te koppelen, trekt u met uw vingers aan de scharnier bovenop het apparaat naar de voorkant van het systeem, zoals getoond in AFBEELDING 5.29. AFBEELDING 5.29: De behuizing loskoppelen na voltooiing van de uitvoering 20.

  • Pagina 85: De Digital Analyzer Bedienen

    ® NanoString Technologies GEBRUIKERSHANDLEIDING De Digital Analyzer bedienen A. Een uitvoering starten Om met de Digital Analyzer een patroon te scannen, meld u zich aan op het instrument. Selecteer de knop Main Menu (Hoofdmenu) op het welkomstscherm om u aan te melden.
  • Pagina 86 OPMERKING: De knop Exit (Afsluiten) verschijnt alleen op het welkomstscherm en het hoofdmenu als de gebruiker het nCounter Dx-analysesysteem met FLEX-configuratie heeft (zie Hoofdstuk 3 – De instrumentmodus selecteren). BELANGRIJK: Als een laboratorium meer dan één Digital Analyzer heeft, moet het patroon op hetzelfde instrument worden gescand als waarop hij bij het Prep Station is geregistreerd die werd gebruikt om de monsters te verwerken (zie Hoofdstuk 4 –...
  • Pagina 87 NanoString Technologies ® GEBRUIKERSHANDLEIDING Plaats het monsterpatroon in een lege sleuf. Zorg dat het patroon in de juiste richting is geplaatst (de sleuf en het patroon zijn ingekeept om de juiste plaatsing te helpen verzekeren) en volledig plat in de sleuf zit. De streepjescode moet opwaarts gericht zijn 6.4).
  • Pagina 88 GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter ® Dx-analysesysteem De scanner gebruikt de streepjescode om de uitvoeringsset te zoeken die met het patroon verwant is en bepaalt of het patroon al klaar is om te worden gescand. Zodra de zes posities zijn gecontroleerd, verschijnt het scherm ‘Counting Cartridges’ (Patronen tellen). Elke sleuf heeft vijf mogelijke statussen: •...
  • Pagina 89 NanoString Technologies ® GEBRUIKERSHANDLEIDING Bevestig dat aan de onderkant van het gescande patroon een kleine blauwe balk verschijnt wat aangeeft dat het scannen is gestart. Er zal een reeks ritmische kliktonen klinken als de beelden worden verzameld. Om aan een Digital Analyzer een patroon toe te voegen dat al aan het tellen is, drukt u op het scherm ‘Counting Cartridges’...

  • Pagina 90: Technische Ondersteuning En Onderhoud

    A. Technische ondersteuning Technische ondersteuning is beschikbaar via telefoon, fax, post of e-mail. Zorg dat u het productnummer en serienummer in alle communicaties noemt. Contactinformatie Verenigde Staten: NanoString Technologies, Inc. 530 Fairview Ave N Seattle, WA 98109 VS Telefoon: +1.888.358.NANO (+1.888.358.6266) Fax: +1.206.378.6288...

  • Pagina 91: Vermogenscyclus Van Instrument

    NanoString Technologies ® GEBRUIKERSHANDLEIDING B. Vermogenscyclus van instrument Het wordt aangeraden dat voor elk instrument periodiek het systeemvermogen cyclisch wordt verlopen (bijvoorbeeld eens elke twee weken na smering van de O-ring van het Prep Station). Onderhouds- en ondersteuningsfuncties zijn vanaf het hoofdmenu van het Prep Station en de Digital Analyzer bereikbaar.
  • Pagina 92 GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter ® Dx-analysesysteem Selecteer Confirm (Bevestigen) om de systeemafsluiting voort te zetten. AFBEELDING 7.3: Berichten over systeemafsluiting worden door het Prep Station (links) en de Digital Analyzer (rechts) weergegeven. >>> Het systeem wordt afgesloten. Na de systeemafsluiting (er is een vertraging van ongeveer 30 seconden) moet u de aan-uitschakelaar op de achterkant van het instrument zoeken en de voeding uitschakelen.

  • Pagina 93: Onderhoud Van Prep Station

    NanoString Technologies ® GEBRUIKERSHANDLEIDING C. Onderhoud van Prep Station Onderhouds- en ondersteuningsfuncties zijn vanaf het hoofdmenu van het Prep Station bereikbaar. Gebruikers moeten de benodigde toestemmingen toegewezen hebben gekregen door de beheerder om deze functies te kunnen uitvoeren. Alleen beheerders mogen het systeem afsluiten.
  • Pagina 94 GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter ® Dx-analysesysteem Als de elektrode ernstig is verbogen, tot het punt dat hij niet in een patroon kan worden geplaatst, sluit u de elektrodebehuizing zonder een patroon erin en stelt u de positie van de elektrode af zodat hij gelijk aan de andere elektroden is geplaatst. Als hij iets is verbogen en er kan een patroon worden ingevoerd door de verbogen elektrode iets te manoeuvreren, dan plaatst u een patroon voordat u de elektrodebehuizing sluit.
  • Pagina 95 NanoString Technologies ® GEBRUIKERSHANDLEIDING Gebruik een pincet en buig de elektroden voorzichtig in een uitlijning door te proberen de punt van de elektroden uit te lijnen met het midden en de bodem van de patroonput. Tik op Next (Volgende). >>> Het eindscherm verschijnt waarmee de procedure wordt beëindigd.

  • Pagina 96: O-Ring Smering

    GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter ® Dx-analysesysteem O-ring smering De O-ringen op de pipettuiten in het Prep Station zijn aanwezig om een afdichting te verzekeren met de pipetpunten, waardoor een nauwkeurige volumeregeling van vloeistof wordt verzekerd. O-ringen zijn de kleine zwarte ringen die op het onderste uiteinde van de tuit zitten. Deze O-ringen moeten regelmatig worden gesmeerd om een goede afdichting te verzekeren.
  • Pagina 97 NanoString Technologies ® GEBRUIKERSHANDLEIDING Selecteer vanaf het menu Maintenance (Onderhoud) de optie Lubricate O-rings (O-ringen smeren). >>> Er verschijnt een aantal onderhoudsschermen voor ‘O-ringen smeren’ . AFBEELDING 7.9: De schermen die worden weergegeven bij de verschillende stappen in de werkstroom ‘Lubricate O-rings’...
  • Pagina 98 7.10. AFBEELDING 7.10: Gebruik een vinger om een kleine hoeveelheid NanoString-siliconensmeer op de O-ringen aan te brengen Veeg met pluisvrij papier eventueel overmatig siliconensmeer van de tuiten en puntejectoren af. Beweeg de vinger voorzichtig rondom elke ring om de smeer evenredig te verdelen.

  • Pagina 99: Logboekbestanden Downloaden

    ® GEBRUIKERSHANDLEIDING Logboekbestanden downloaden Als zich een probleem voordoet, kan NanoString-ondersteuning u vragen de logboekbestanden van het systeem te downloaden. Selecteer in het menu Maintenance (Onderhoud) de knop Download Logs (Logboeken downloaden). Logboekbestanden worden op datum van elke uitvoering opgeslagen (AFBEELDING 7.11).

  • Pagina 100: Onderhoud Van Digital Analyzer

    Als de Digital Analyzer is afgesloten, dan is de webapplicatie niet beschikbaar en is het Prep Station onbestuurbaar. De Digital Analyzer is ontworpen om geen ander onderhoud te vereisen van de gebruiker dan vermogenscyclus van instrumenten (zie vorige paragraaf). Als zich echter problemen voordoen, kan NanoString-ondersteuning u vragen de logboekbestanden te downloaden. Logboekbestanden downloaden Selecteer in het menu Maintenance (Onderhoud) de knop Download Logs (Logboeken downloaden).

  • Pagina 101: Reinigingsinstructies

    • Het apparaat mag bij geen enkele lidstaat van de Europese Unie worden verwijderd via de gemeentelijke afvalinzameling. Voor producten onder de vereisten van de WEEE-richtlijn dient u contact op te nemen met uw dealer of lokale NanoString-kantoor voor de juiste decontaminatie-informatie en terugnameprogramma dat de juiste verzameling, behandeling, herstel, recycling en veilige afvalverwijdering van het apparaat omvat.

  • Pagina 102: Symbolen En Definities

    ® GEBRUIKERSHANDLEIDING nCounter Dx-analysesysteem Symbolen en definities – Fabrikant – Bevoegde vertegenwoordiger in de Europese Gemeenschap – In vitro diagnostisch medisch apparaat – Raadpleeg de gebruiksinstructies – CE-markering – Catalogus- of referentienummer – Batchcode/partijnummer – Serienummer – Bevat voldoende voor <n> tests –...
  • Pagina 103 NanoString Technologies GEBRUIKERSHANDLEIDING NanoString Technologies, Inc. CONTACT INFORMATIE 530 Fairview Ave N info@nanostring.com Verenigde Staten: us.sales@nanostring.com Seattle, Washington 98109 V.S. Tel: +1.888.358.6266 Europa: europe.sales@nanostring.com Fax: +1.206.378.6288 Overige landen: info@nanostring.com www.nanostring.com © 2013-2017 NanoString Technologies, Inc. Alle rechten voorbehouden. 2017-07 MAN-10011-06...

Inhoudsopgave