Inhoudsopgave
Advertenties
5.1
Voorbereiden van de geldata
Scannen van gels
Kijk voor informatie over het scannen van een gel in de documentatie van de gebruikte
gelscanner.
IJkpunten
Voor spot picking van gels met de Ettan Spot Picker zijn twee ijkpunten nodig. De ijkpunten
worden door de Ettan Spot Picker gebruikt om de beeldcoördinaten (X, Y-pixels) voor elke
spot om te zetten in een millimetrische positie waar de uitsnede gemaakt moet worden.
Zo kan een uitsnede gemaakt worden uit gels waarvan de eiwitzones fluorescerend
gelabeld zijn, maar ook uit gels waar de eiwitten met zichtbare zones gekleurd zijn.
Zie de Ettan Spot Picker User Manual voor instructies.
Selectie van zones op de gel en
aanmaken van een picklijst
De basis van spot picking met de Ettan Spot Picker wordt gevormd door een picklijst die
aangemaakt wordt door een beeldanalysesoftware zoals DeCyder 2-D Differential
Analysis Software.
De picklijst moet in principe de plaats, in pixels, van het centrum van elke uit te snijden
zone bevatten. Het moet ook de pixelcoördinaten van het midden van de twee ijkpunten
bevatten.
Zie DeCyder 2-D Software User Manual voor het aanmaken van een picklijst in de DeCyder
2-D Differential Analysis Software. Zie de desbetreffende documentatie om een picklijst
met andere beeldanalysesoftware aan te maken, en de Ettan Spot Picker User Manual.
Ettan Spot Picker Gebruiksaanwijzing 28-9649-84 AB
5 Gebruik
5.1 Voorbereiden van de geldata
47
Advertenties
Hoofdstukken
Inhoudsopgave
