Inhoudsopgave
Advertenties
3 Systeembeschrijving
3.1 Instrument
3.1
Instrument
Inleiding
Het Ettan Spot Picker-systeem is ontworpen voor het automatisch wegsnijden en over-
brengen van polyacrylamide-gelpluggen, met daarin eiwitten, van 1-D of 2-D-elektrofo-
rese-gels naar microtiterplaten Deze gelpluggen zijn geschikt voor verdere bewerkingen
voorafgaand aan massaspectrometrie-analyse.
Gels moeten normaliter op een kunststof of glazen onderlaag geïmmobiliseerd worden.
Met de meegeleverde Ettan Spot Picker Nonbacked Gel Kit kunnen echter gels zonder
onderlaag worden gebruikt.
Typische workflow
Fase
1
2
3
26
Omschrijving
2D-gels die achteraf gekleurd zijn met Coomassie™, zilver- of SYPRO™-
kleurstoffen of vooraf gelabelde eiwitten die fluorescerend gekleurd zijn met
CyDye™ DIGE worden gescand.
Het gescande beeld wordt geanalyseerd met de DeCyder™ 2-D Differential
Analysis Software of andere geschikte software en er wordt een picklijst
geprepareerd voor interessante zones. Tijdens de beeldanalyse moeten een
paar ijkpunten in de gel opgenomen en gedetecteerd worden. Deze ijkpunten
worden gebruikt om de beeldcoördinaten (pixels) te transformeren in afstand-
waarden voor spot picking. Daarnaast kunnen plekken handmatig worden
gepickt zonder het gebruik van een picklijst (zie
zonder picklijst, op pagina
Ettan Spot Picker snijdt gelpluggen uit de gel volgens de picklijst en zet ze
af in microtiterplaten met 96 wells, samen met een volume afgiftevloeistof.
Uitsneden maken in een gel
87).
Ettan Spot Picker Gebruiksaanwijzing 28-9649-84 AB
Advertenties
Hoofdstukken
Inhoudsopgave
